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財政部表示，納稅義務人對於稅捐稽徵機關核定的稅捐或罰鍰處分不服，申請復查，遭稅捐稽徵機關駁回，向該部提起訴願，復遭駁回者，可在收到訴願決定書的次日起2個月內向管轄高等行政法院提起行政訴訟；如果納稅義務人不願提起行政訴訟或遲誤提起行政訴訟期間，而有再審事由者，可向該部申請再審。

財政部說明，申請再審，是特殊的救濟手段，必須在訴願決定「確定」，而且有再審事由者，才能提出申請。上述所稱的再審事由，依照訴願法第97條規定，包括一、適用法規顯有錯誤。二、決定理由與主文顯有矛盾。三、決定機關之組織不合法。四、依法令應迴避之委員參與決定。五、參與決定之委員關於該訴願違背職務，犯刑事上之罪。六、訴願之代理人，關於該訴願有刑事上應罰之行為，影響於決定。七、為決定基礎之證物，係偽造或變造。八、證人、鑑定人或通譯就為決定基礎之證言、鑑定為虛偽陳述。九、為決定基礎之民事、刑事或行政訴訟判決或行政處分已變更。十、發見未經斟酌之證物或得使用該證物等10項。至於申請期限，則應在訴願決定確定時起算30日內提起；如果再審事由發生在後或知悉在後，則自知悉時起算。

邇來有部分納稅義務人不服財政部訴願決定，未向行政法院提起行政訴訟，而於未確定時，即逕向財政部申請訴願再審，因與規定不合，遭財政部作成「再審不受理」的再審決定。為避免發生類似情形，財政部特別提醒納稅義務人，訴願決定尚未確定者，依法尚不能申請訴願再審，必須在訴願決定確定，而且有再審事由，始可申請再審，而申請時也必須遵守申請再審期間，以保障自己的權益。